Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP58Q9BVL2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms