Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP8Q9BV40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP8Q9BV40 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms