Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf16Q9BUW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms