Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDC1Q9BTX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms