Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM43Q9BTV4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM43Q9BTV4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM43Q9BTV4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms