Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4K2AQ9BTU6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PI4K2AQ9BTU6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms