Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms