Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM79Q9BSE2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms