Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG101Q9BSB4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG101Q9BSB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms