Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM175Q9BSA9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM175Q9BSA9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms