Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP44Q9BS26 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP44Q9BS26 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP44Q9BS26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms