Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MESP1Q9BRJ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms