Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C20orf78Q9BR46 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms