Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZSWIM1Q9BR11 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms