Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP3Q9BQQ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP3Q9BQQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms