Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMCHL2Q9BQD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms