Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMSS1Q9BQ75 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMSS1Q9BQ75 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms