Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF15Q99988 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF15Q99988 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms