Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP1Q99653 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP1Q99653 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms