Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD180Q99467 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD180Q99467 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD180Q99467 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD180Q99467 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD180Q99467 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD180Q99467 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD180Q99467 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms