Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP89Q96ST8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP89Q96ST8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms