Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms