Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DCLRE1CQ96SD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1CQ96SD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCLRE1CQ96SD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms