Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms