Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK1Q96SB4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK1Q96SB4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK1Q96SB4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK1Q96SB4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK1Q96SB4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK1Q96SB4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK1Q96SB4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms