Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRAMP1Q96RY5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRAMP1Q96RY5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms