Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CICQ96RK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms