Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNDC3BQ96NL0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC3BQ96NL0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms