Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF558Q96NG5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF558Q96NG5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms