Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM20AQ96MK3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20AQ96MK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms