Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCMTD1Q96MG8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD1Q96MG8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms