Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms