Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms