Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED3Q96IU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZBED3Q96IU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED3Q96IU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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