Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BCANQ96GW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms