Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP36Q96G28 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP36Q96G28 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP36Q96G28 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms