Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED8Q96G25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED8Q96G25 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms