Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CERS2Q96G23 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERS2Q96G23 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 795.5 ms