Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFT43Q96FT9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT43Q96FT9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms