Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC4Q96FT7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms