Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM19Q96E16 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM19Q96E16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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