Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERP27Q96DN0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms