Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN4Q96CB9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms