Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD2Q96BF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms