Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35C1Q96A29 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35C1Q96A29 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms