Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1E2Q96A05 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E2Q96A05 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms