Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM63Q969Q1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRIM63Q969Q1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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