Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCSTNQ92542 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms