Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SREK1Q8WXA9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREK1Q8WXA9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms