Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY2Q8WXA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUFY2Q8WXA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms